Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms