Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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