Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms