Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms