Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XBP1P17861 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XBP1P17861 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XBP1P17861 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XBP1P17861 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XBP1P17861 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XBP1P17861 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
XBP1P17861 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XBP1P17861 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XBP1P17861 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XBP1P17861 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XBP1P17861 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XBP1P17861 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XBP1P17861 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XBP1P17861 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XBP1P17861 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XBP1P17861 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XBP1P17861 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms