Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCF2P10911 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCF2P10911 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCF2P10911 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCF2P10911 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms