Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHGAP10645 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHGAP10645 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms