Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BP0C0L5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms