Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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PTPRCP08575 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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PTPRCP08575 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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PTPRCP08575 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRCP08575 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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