Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04436 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04436 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04436 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04436 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04436 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
P04436 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
P04436 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04436 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04436 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04436 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04436 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04436 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04436 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04436 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04436 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04436 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04436 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04436 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04436 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms