Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SPTA1P02549 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SPTA1P02549 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SPTA1P02549 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SPTA1P02549 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SPTA1P02549 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SPTA1P02549 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTA1P02549 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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