Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf47O95873 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf47O95873 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms