Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARP2O94887 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARP2O94887 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARP2O94887 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms