Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA10O75578 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA10O75578 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA10O75578 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA10O75578 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA10O75578 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA10O75578 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA10O75578 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA10O75578 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA10O75578 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA10O75578 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA10O75578 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA10O75578 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms