Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBDO15205 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBDO15205 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBDO15205 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBDO15205 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBDO15205 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBDO15205 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBDO15205 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBDO15205 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBDO15205 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBDO15205 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBDO15205 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms