Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms