Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP17L13C9JLJ4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP17L13C9JLJ4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms