Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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C4orf47A7E2U8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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C4orf47A7E2U8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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C4orf47A7E2U8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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C4orf47A7E2U8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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C4orf47A7E2U8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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C4orf47A7E2U8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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C4orf47A7E2U8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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