Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms