Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms