Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms