Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms