Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms