Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms