Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CPNE7Q9UBL6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CPNE7Q9UBL6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CPNE7Q9UBL6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CPNE7Q9UBL6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CPNE7Q9UBL6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CPNE7Q9UBL6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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CPNE7Q9UBL6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPNE7Q9UBL6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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