Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms