Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL9Q9P2J3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms