Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD1BQ9P298 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms