Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD5Q9P267 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms