Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MKS1Q9NXB0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms