Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLN6Q9NWW5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLN6Q9NWW5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLN6Q9NWW5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLN6Q9NWW5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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