Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms