Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TREX1Q9NSU2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TREX1Q9NSU2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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