Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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