Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHST12Q9NRB3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms