Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLMQ9NP87 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms