Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms