Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms