Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms