Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms