Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms