Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms