Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms