Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms