Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms