Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms