Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GCN1Q92616 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GCN1Q92616 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GCN1Q92616 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GCN1Q92616 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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GCN1Q92616 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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GCN1Q92616 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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GCN1Q92616 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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GCN1Q92616 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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GCN1Q92616 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCN1Q92616 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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