Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOPBP1Q92547 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms