Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms