Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms